Биологи секвенировали древнейший геном возрастом 50 тысяч лет

Палеогенетики совершили прорыв в изучении древней ДНК из Африки — региона, где жаркий климат обычно не позволяет молекулам сохраняться долгое время. В статье, опубликованной в журнале Quaternary Science Reviews, учёные сообщают, что им удалось секвенировать генетический материал из зуба горного редунки, жившего на юге континента примерно 50 тысяч лет назад. Это самый древний африканский геном из когда-либо прочитанных, и его возраст значительно превышает прежние рекорды.

За последние 15 лет палеогенетика совершила колоссальный скачок — в благоприятных условиях, таких как вечная мерзлота, ДНК может сохраняться более миллиона лет. Однако в тёплых регионах, особенно в Африке, генетический материал разрушается быстро. До сих пор учёным удавалось получить древние геномы из Северной Африки возрастом около 15–14 тысяч лет и один образец из Южной Африки возрастом около 10 тысяч лет. Но образцов старше этого рубежа почти не было.

Международная группа под руководством Элин Лоренцен из Копенгагенского университета решила проверить, насколько хорошо может сохраняться ДНК в костях и зубах диких животных из шести южноафриканских местонахождений. Всего они отобрали 320 образцов, относящихся к шести видам полорогих и датируемых поздним плейстоценом и голоценом. Из 144 образцов, протестированных на сохранность ДНК, в 65 случаях материала было достаточно для видовой идентификации. В 62 случаях определения палеонтологов подтвердились, но в двух образцах кости редунков оказались останками косульих антилоп. Самый ценный результат дал зуб из пещеры Бумплаас — палеонтологи ошибочно приписали его большому редунке, а генетический анализ показал, что это горный редунка. Его возраст — как минимум 50 тысяч лет.

Кроме того, учёные секвенировали ДНК из трёх зубов вымерших буйволов Syncerus antiquus из пещеры Нельсон-Бей: два образца оказались возрастом 21–23,5 тысячи лет, ещё один — 12–14,1 тысячи лет. Остальные 61 образец с сохранившейся ДНК относились к голоцену, их возраст в среднем составил около 3,1 тысячи лет. Это открытие не только устанавливает новый рекорд древности для африканской ДНК, но и показывает, что в пещерах юга континента генетический материал может сохраняться значительно лучше, чем считалось ранее. Учёные надеются, что эти находки откроют новые страницы в понимании эволюции фауны Африки в эпоху позднего плейстоцена. Недавно подобный прорыв случился и с древней РНК — её секвенировали из мамонтёнка Юки, жившего 40 тысяч лет назад в Якутии. Теперь очередь за Африкой.